Na škole působí čtyři ateliéry architektury, každý se specifickým pedagogickým zaměřením – A1 Jana Šépky (od roku 2014), A2 Evy Franch i Gilabert (od roku 2022), A3 Imro Vaška (od 2011) a A4 Romana Brychty (od roku 2011). Katedra architektury těžila již od svého založení ze spolupráce s výtvarnými katedrami a katedrami užitého umění. Studenti tak mají možnost rozvíjet své schopnosti také v rámci výuky řemeslných technik, modelování, malby či kresby. Kromě spojení s výtvarnými obory katedra architektury profiluje vlastní výuku doprovodných technických disciplin a udržuje úzkou spolupráci s řadou odborníků, specialistů v široké škále této oblasti a v neposlední řadě též s katedrou teorie a dějin umění. Tento profil z ní činí jedinečnou instituci na poli vzdělávání budoucích architektů.